從結(jié)構(gòu)來看，各地區(qū)的創(chuàng)新能力指數(shù)結(jié)構(gòu)沒有明顯差異，均主要由創(chuàng)新績效帶動，創(chuàng)新支撐略顯不足，提高創(chuàng)新水平是后續(xù)發(fā)展的關(guān)鍵;從地域分布來看，西部地區(qū)無論是創(chuàng)新能力指數(shù)還是三類分項指數(shù)，均不如中、東部地區(qū)，但差異不大。

在創(chuàng)新支撐方面，國家農(nóng)業(yè)科技園區(qū)人才隊伍建設(shè)已初具規(guī)模，科技特派員與自有研發(fā)隊伍成為園區(qū)創(chuàng)新的重要人才支撐;園區(qū)創(chuàng)新平臺建設(shè)普遍得到重視，實驗儀器設(shè)備不斷完善;園區(qū)研發(fā)投入強度與高新區(qū)科技投入相當，而且投融資渠道不斷拓寬，土地投融資強度加大。

在創(chuàng)新水平方面，園區(qū)每百名研發(fā)人員申請發(fā)明專利數(shù)與全國每百名研發(fā)人員申請發(fā)明專利數(shù)水平相當，但園區(qū)之間差異較大，有大學和科研機構(gòu)支撐的園區(qū)在創(chuàng)新水平方面的表現(xiàn)明顯出色;以科技引進為指征的園區(qū)集成創(chuàng)新能力不斷增強，中西部園區(qū)科技引進水平高于東部園區(qū);以科技推廣為指征的園區(qū)成果輻射能力仍有較大提升空間，且中部園區(qū)科技推廣水平優(yōu)于東、西部園區(qū)。

在創(chuàng)新績效方面，近三年園區(qū)產(chǎn)值平均增幅顯著高于我國GDP平均增幅，創(chuàng)新效益明顯;多數(shù)園區(qū)以終端消費性農(nóng)產(chǎn)品生產(chǎn)為主，產(chǎn)業(yè)帶動能力有待提升。