一般講的微生物肥料，其實(shí)是衛(wèi)生菌劑產(chǎn)品，是一類微生物群體組合物。這類微生物菌劑能夠提供一種或多種對作物生長有益的微生物群落。由于農(nóng)業(yè)上應(yīng)用的微生物菌劑常常和草炭、泥炭、有機(jī)肥料等有機(jī)質(zhì)含量較高的基質(zhì)混合在一起，所以習(xí)慣上把微生物菌劑稱為微生物肥料，人們俗稱為“菌肥”。
微生物肥料的作用機(jī)理不同于無機(jī)化學(xué)肥料。 枯草芽孢桿菌 能夠提供一種微生物群落的叫“單一微生物肥料”或“專一微生物菌劑（肥料）”；能夠提供兩種以上多種微生物群落的叫“復(fù)合微生物菌劑（肥料）”。根據(jù)微生物的作用劃分，可以將微生物菌劑劃分為“固氮細(xì)菌（菌劑）”、“解磷細(xì)菌（菌劑）”、“解鉀細(xì)菌（菌劑）”、“腐解細(xì)菌（菌劑）”等。這些微生物菌劑都可以選擇性地為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)服務(wù)。
        微生物肥料的作用主要是提供對作物生長有益的“微生物群落”，而不是“營養(yǎng)元素”。這些有益的微生物施到土壤中后，能產(chǎn)生各種不同作用。例如：以固氮細(xì)菌為主的微生物肥料能通過細(xì)菌的活動，固定空氣中的氮元素，供作物生長時(shí)吸收利用——即“固氮”作用；以解磷細(xì)菌為主的微生物肥料則通過細(xì)菌的活動，分解土壤中部分不能被作物吸收的磷元素，使磷從土壤中分解出來，供作物生長時(shí)吸收利用——即“解磷”作用；